Mastodonのスタートアップスクリプトでは、現状 git clone https://github.com/tootsuite/mastodon.git live というgitコマンドでソースコードを取得しています。しかし、Mastodonは現在次期大型アップデートv4に向けてプロジェクトが進んでおり、この方法で取得される最新バージョンは現行バージョンv3に比べてまだ機能不全なところもあります。実際、このスタートアップスクリプトでセットアップしたインスタンスにはまだ必要不可欠ないくつかの機能が使えなかった上、スクリプトの詳細ページに記載されているドキュメントもv4に非対応です。(例えばAdminアカウントのセットアップ方法に変更が加わっている上、Sidekiqのqueueの種類も変更になっているためsystemdの設定ファイルの変更も必要です。)
そのため、releaseとしてtagが切られているものに限定した最新のものを取得するようにコマンドを変更するべきだと思いました。今はたまたまそういう時期なのでコスパには見合わないかもしれませんが、将来的には有用だと思いますので変更の検討をお願いします。